Вивек Агнихотри родился в Гвалиоре и получил образование в разных индийских и международных учебных заведениях, включая Indian Institute of Mass Communication и Harvard Extension School. Путь в индустрию он начал в рекламе, работая в крупных агентствах Ogilvy и McCann, после чего занялся производством телесериалов, где получил положительные отзывы и первые значимые профессиональные контакты. Эти проекты стали мостом к его переходу в полнометражное кино.

Дебютировал он в Болливуде криминальным триллером Chocolate, однако последующие фильмы долгое время не приносили ему желаемого прорыва. Работы Dhan Dhana Dhan Goal, Hate Story, Buddha in a Traffic Jam, Junooniyat и Zid не получили признания критиков и не стали заметными событиями в прокате. Большинство его проектов в этот период характеризовались невысокими сборами и неоднозначными отзывами.

Переломным моментом стал политический триллер The Tashkent Files, который неожиданно стал коммерческим хитом и получил Национальную кинопремию за диалоги. Ещё более широкую известность Агнихотри получил после фильма The Kashmir Files, ставшего одним из самых кассовых фильмов 2022 года и удостоенного премии имени Наргис Датт за вклад в национальную интеграцию. Одновременно фильм вызвал масштабные общественные дискуссии, что резко подняло статус режиссёра в публичном пространстве. Его следующий проект, The Vaccine War, оказался кассовым провалом, а документальные работы The Kashmir Files: Unreported и The Bengal Files получили смешанные отзывы.

Помимо кино, он активно участвует в общественной деятельности, пишет книги и выступает с лекциями в Индии и за её пределами. Его книга Urban Naxals вызвала широкий общественный резонанс и стала частью политических дискуссий о роли университетов и медиа. Агнихотри регулярно комментирует вопросы культуры и медиасреды и занимает заметное место среди режиссёров, работающих на стыке кино и общественной полемики.

В личной жизни он женат на актрисе Паллави Джоши, с которой сотрудничал и профессионально. Пара воспитывает двух детей. В разные годы он сталкивался с юридическими спорами и публичными обвинениями, что также формировало его медийное присутствие и делало его одним из наиболее обсуждаемых режиссёров своего поколения.