Мегха Чоудхури родилась 7 февраля 1997 года в Калькутте, Западная Бенгалия, Индия. Ее карьера в кино началась за кадром, когда в возрасте 16 лет она работала ассистентом режиссера для фильма Haseena Parkar и ассистентом по кастингу для M.S. Dhoni: The Untold Story.
Ее актерский дебют состоялся в 2016 году в бенгальском фильме Amar Prem, где она исполнила главную роль. Позже, в 2019 году, Мегха Чоудхури сделала свой дебют в Толливуде с триллером Marshal, где сыграла журналистку. В том же году она снялась в телугу фильме Oorantha Anukuntunnaru, воплотив образ «девушки по соседству».
Одним из значимых проектов в ее карьере стал тамильский фильм Varmaa, ремейк популярного фильма Arjun Reddy. Мегха Чоудхури была выбрана на роль в 2018 году, однако из-за проблем между режиссером и продюсером выход фильма был отложен, и он был выпущен на OTT-платформах только 6 октября 2020 года.
В последующие годы актриса продолжила активно сниматься в фильмах на телугу. В 2023 году она появилась в фильме Phalana Abbayi Phalana Ammayi, а в 2024 году вышел триллер Tenant, где Мегха Чоудхури исполнила одну из ведущих ролей.
В ее фильмографии также числятся будущие проекты, например, фильм Jigel, выход которого ожидается в 2025 году.