Джон Коккен родился в триссурской малайялийской семье, но вырос в Мумбаи. Его отец работал заместителем директора школы, мать была медсестрой, что формировало строгую, но поддерживающую семейную атмосферу. Коккен учился в Mumbai St. Xavier’s College, сначала выбрав направление BSE, а затем попробовав себя в гостиничном деле. Однако академическая траектория быстро уступила место модельному бизнесу, где он впервые ощутил вкус публичной профессии.

Участие в конкурсе Gladrags 2005 стало переломным моментом: оказавшись в финальной десятке, он понял, что хочет двигаться дальше в сторону актёрства. После моделйного периода Коккен дебютировал в кино в 2006 году и начал активно появляться в проектах четырёх южноиндийских индустрий. Ранние годы он провёл в характерных и отрицательных ролях, постепенно закрепляя репутацию надёжного актёра второго плана. Его заметили в Yevadu, затем в Baahubali: The Beginning, а позже — в K.G.F., что заметно расширило его аудиторию.

Серьёзный творческий прорыв произошёл в Sarpatta Parambarai, где Коккен сыграл Вембули — сложный, мощный физически и психологически образ. Затем последовали проекты вроде Thunivu (2023), где он стал главным антагонистом, а также работы в стриминговых сериалах The Village и The Freelancer. Постепенно Коккен превращается в одного из наиболее востребованных актёров, способных придать злодеям масштаб и харизму.

В личной жизни у него были два брака. С 2012 по 2016 год он был женат на актрисе Меере Васудеван, от этого союза есть сын. В 2019 году он женился на актрисе Пудже Рамачандран, и в 2023 году у пары родился сын. Несмотря на интенсивный график, Коккен активно участвует в семейной жизни и редко обсуждает её в публичном пространстве, предпочитая сосредотачиваться на работе.