Gunasekhar родился 2 июня 1964 года. До перехода к самостоятельной режиссуре он работал ассистентом у таких режиссёров, как Д. В. Нарсараджу, Кранти Кумар и Рам Гопал Варма, что дало ему прочную профессиональную базу. Его режиссёрский дебют Lathi (1992) имел социально-политическую направленность и принёс ему премию Nandi за лучший дебют.
Широкое признание Гунасекхар получил после романтического фильма Sogasu Chooda Tharamaa (1995), который стал хитом и был отмечен премией Nandi как лучший художественный фильм. В 1997 году он снял мифологический эпос Ramayanam, предназначенный для детской аудитории. Картина получила Национальную кинопремию за лучший детский фильм и была показана на Международном детском кинофестивале Индии, что закрепило за режиссёром репутацию автора нестандартных проектов.
Конец 1990-х и начало 2000-х стали для него периодом коммерческого успеха. Экшен-триллер Choodalani Vundi (1998) стал кассовым хитом и вошёл в историю телугу-кино как первый фильм с использованием технологии DTS. Затем последовал политический триллер Manoharam (2000), снова отмеченный премиями Nandi. Настоящим прорывом стал фильм Okkadu (2003), который стал самым кассовым телугу-фильмом года и позже был переснят на нескольких индийских языках.
В последующие годы Гунасекхар продолжал экспериментировать с масштабными формами. Его историческая драма Rudhramadevi (2015) с большим размахом рассказывала о легендарной правительнице династии Какатия. Несмотря на противоречивые отзывы критиков, фильм показал средние кассовые результаты и подтвердил интерес режиссёра к историко-мифологическим сюжетам. Последний на сегодняшний день проект — Shaakuntalam (2023), мифологическая романтическая драма, которая была резко раскритикована и стала коммерческим провалом.
В личной жизни Гунасекхар женат на Рагини, у пары две дочери — Нилима и Юкта. Семья неоднократно принимала участие в его кинопроектах, особенно в продюсерских и организационных аспектах.
